MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 65773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022226	CACT	2	8	149	156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022226	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022226	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022226	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022226	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022226	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022226	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022226	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022226	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022226	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022226	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
13	NC_022226	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
14	NC_022226	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459745
15	NC_022226	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459745
16	NC_022226	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
17	NC_022226	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459745
18	NC_022226	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
19	NC_022226	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
20	NC_022226	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	537459745
21	NC_022226	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459745
22	NC_022226	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
23	NC_022226	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	537459745
24	NC_022226	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459745
25	NC_022226	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459745
26	NC_022226	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
27	NC_022226	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
28	NC_022226	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459745
29	NC_022226	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
30	NC_022226	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
31	NC_022226	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
32	NC_022226	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459745
33	NC_022226	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
34	NC_022226	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
35	NC_022226	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
36	NC_022226	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
37	NC_022226	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	537459745
38	NC_022226	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	537459745
39	NC_022226	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
40	NC_022226	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459745
41	NC_022226	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	537459745
42	NC_022226	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	537459745
43	NC_022226	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	537459745
44	NC_022226	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
45	NC_022226	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459745
46	NC_022226	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	537459745
47	NC_022226	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	537459745
48	NC_022226	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
49	NC_022226	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
50	NC_022226	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022226	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022226	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022226	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022226	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022226	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022226	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022226	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022226	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022226	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
60	NC_022226	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
61	NC_022226	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
62	NC_022226	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459746
63	NC_022226	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
64	NC_022226	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459746
65	NC_022226	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	537459746
66	NC_022226	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
67	NC_022226	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	537459746
68	NC_022226	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
69	NC_022226	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	537459746
70	NC_022226	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
71	NC_022226	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459746
72	NC_022226	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	537459746
73	NC_022226	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
74	NC_022226	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
75	NC_022226	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	537459746
76	NC_022226	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
77	NC_022226	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459746
78	NC_022226	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	537459746
79	NC_022226	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
80	NC_022226	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459746
81	NC_022226	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
82	NC_022226	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
83	NC_022226	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459746
84	NC_022226	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
85	NC_022226	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
86	NC_022226	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459746
87	NC_022226	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	537459746
88	NC_022226	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
89	NC_022226	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	537459746
90	NC_022226	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
91	NC_022226	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
92	NC_022226	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
93	NC_022226	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459746
94	NC_022226	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	537459746
95	NC_022226	TAAAAA	2	12	3287	3298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	537459746
96	NC_022226	TAAATA	2	12	3299	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022226	ATTA	2	8	3323	3330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022226	T	6	6	3346	3351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022226	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022226	AAAT	2	8	3380	3387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022226	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022226	TTTAAA	2	12	3475	3486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022226	A	6	6	3543	3548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022226	A	6	6	3569	3574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022226	AATT	2	8	3579	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022226	A	7	7	3635	3641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022226	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022226	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459747
109	NC_022226	AAG	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459747
110	NC_022226	GTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459747
111	NC_022226	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459747
112	NC_022226	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459747
113	NC_022226	ATTA	2	8	3798	3805	50 %	50 %	0 %	0 %	537459747
114	NC_022226	TTCT	2	8	3888	3895	0 %	75 %	0 %	25 %	537459747
115	NC_022226	TCAT	2	8	3899	3906	25 %	50 %	0 %	25 %	537459747
116	NC_022226	ATG	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
117	NC_022226	A	6	6	4182	4187	100 %	0 %	0 %	0 %	537459748
118	NC_022226	GTC	2	6	4222	4227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459748
119	NC_022226	AT	3	6	4235	4240	50 %	50 %	0 %	0 %	537459748
120	NC_022226	AGA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
121	NC_022226	CTC	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537459748
122	NC_022226	GAC	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459748
123	NC_022226	CTG	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459748
124	NC_022226	AAT	2	6	4398	4403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459748
125	NC_022226	A	7	7	4429	4435	100 %	0 %	0 %	0 %	537459748
126	NC_022226	CAG	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459748
127	NC_022226	AAG	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
128	NC_022226	ATT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
129	NC_022226	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
130	NC_022226	ATA	2	6	4666	4671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459748
131	NC_022226	GAT	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
132	NC_022226	TTA	3	9	4854	4862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
133	NC_022226	GAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
134	NC_022226	TTA	2	6	4905	4910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
135	NC_022226	ACA	2	6	5065	5070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459749
136	NC_022226	GTAT	2	8	5137	5144	25 %	50 %	25 %	0 %	537459749
137	NC_022226	AG	4	8	5159	5166	50 %	0 %	50 %	0 %	537459749
138	NC_022226	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459749
139	NC_022226	CAAAT	2	10	5230	5239	60 %	20 %	0 %	20 %	537459749
140	NC_022226	GTT	2	6	5244	5249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459749
141	NC_022226	A	6	6	5314	5319	100 %	0 %	0 %	0 %	537459749
142	NC_022226	TGG	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
143	NC_022226	TGGCGG	2	12	5375	5386	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537459749
144	NC_022226	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
145	NC_022226	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
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147	NC_022226	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
148	NC_022226	A	6	6	5499	5504	100 %	0 %	0 %	0 %	537459749
149	NC_022226	AAG	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
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152	NC_022226	TGA	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
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158	NC_022226	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
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161	NC_022226	TAT	2	6	6197	6202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
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168	NC_022226	TAGA	2	8	6445	6452	50 %	25 %	25 %	0 %	537459749
169	NC_022226	TGGA	2	8	6571	6578	25 %	25 %	50 %	0 %	537459749
170	NC_022226	TTA	2	6	6597	6602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
171	NC_022226	TTC	2	6	6606	6611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459749
172	NC_022226	TAT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
173	NC_022226	TGAAT	2	10	6740	6749	40 %	40 %	20 %	0 %	537459749
174	NC_022226	AATG	2	8	6794	6801	50 %	25 %	25 %	0 %	537459749
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178	NC_022226	TGAAC	2	10	6981	6990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_022226	AGG	2	6	6997	7002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537459750
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251	NC_022226	AGATGA	2	12	9662	9673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537459750
252	NC_022226	AAT	2	6	9676	9681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459750
253	NC_022226	A	7	7	9682	9688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_022226	TAC	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_022226	TGG	2	6	9819	9824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459751
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258	NC_022226	ACC	2	6	9957	9962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459751
259	NC_022226	T	7	7	10032	10038	0 %	100 %	0 %	0 %	537459751
260	NC_022226	ACACG	2	10	10153	10162	40 %	0 %	20 %	40 %	537459751
261	NC_022226	ATCGC	2	10	10198	10207	20 %	20 %	20 %	40 %	537459751
262	NC_022226	GTA	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459751
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265	NC_022226	TTG	2	6	10403	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459751
266	NC_022226	CAC	2	6	10475	10480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459751
267	NC_022226	CCA	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459751
268	NC_022226	TAA	2	6	10503	10508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459751
269	NC_022226	TCT	2	6	10537	10542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459751
270	NC_022226	AT	3	6	10634	10639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_022226	TAT	2	6	10659	10664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_022226	ATT	3	9	10679	10687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022226	ATT	2	6	10745	10750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_022226	TCA	2	6	15923	15928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_022226	TTA	2	6	16159	16164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459756
404	NC_022226	GAT	2	6	16284	16289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459756
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432	NC_022226	TAAATC	2	12	17177	17188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
433	NC_022226	AAT	2	6	17216	17221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_022226	TTA	2	6	17290	17295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_022226	ATT	2	6	17499	17504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459757
440	NC_022226	TTA	2	6	17567	17572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459757
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445	NC_022226	AAAG	2	8	17680	17687	75 %	0 %	25 %	0 %	537459757
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454	NC_022226	TAT	2	6	18059	18064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459757
455	NC_022226	GT	3	6	18080	18085	0 %	50 %	50 %	0 %	537459757
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481	NC_022226	GAT	2	6	19536	19541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459758
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